Khan Academy направи пълната си библиотека с ресурси достъпна на iPad. От основаването си през 2008 г. организацията е натрупала хиляди видеа, текстове и практически упражнения в различни области, които са достъпни напълно безплатно в официалния сайт.
Доскоро мобилното приложение на услугата предлагаше достъп до всички видеа и текстове, но не и до практическите упражнения. Новата версия на iPad приложението на Khan Academy дава на потребителите пълен достъп до цялото съдържание, налично на сайта, както и някои ексклузивни опции. За курсовете по математика можете да се възползвате от интелигентно анализиране на верните и грешните задачи и съответното време за отговор. На базата на тази информация приложението ви предлага упражнения, с които да подобрите слабите си страни. Въвеждането на информация в някои курсове и воденето на бележки пък стават с автоматично разпознаване на почерк. Към момента iPhone приложението не поддържа разширената функционалност, подобно на версиите за Android и Windows Phone.